مجلس الاتحاد هو المجلس الرقابي المنتخب من قبل الجمعية العمومية ويتكون من 5 أعضاء رئيسه هو رئيس الجمعية العمومية.

مسؤول عن اداء وظيفة التدقيق الداخلي للاتحاد إدارياً ومالياً، وإصدار الجزاءات الضرورية وتنفيذها عبر الطرق المقررة في النظام الأساسي لكن ليس له اي دور تنفيذي.

د.أحمد الجعلي

رئيس المجلس
دكتوراه 

اياد عبدالماجد

مقرر المجلس
بكلاريوس

محمد عبدالرحمن

نائب ثالث
بكلاريوس

مصطفى حاتم

نائب ثاني
بكلاريوس

د.زين العابدين

نائب أول
دكتوراه